抵扣联和联的区别有：1、抵扣联是给购货方作为抵扣的，联是给购货方的作为记账的凭证的；2、抵扣联要给退税科提供，用于税款抵扣的，联做为记账用，是购物凭证；3、抵扣联认证了之后，单独订起来。
《中华人民共和国管理办法实施细则》第三条的基本联次包括存根联、联、记账联。存根联由收款方或开票方留存备查；联由付款方或受票方作为付款原始凭证；记账联由收款方或开票方作为记账原始凭证。省以上税务机关可根据管理情况以及纳税人经营业务需要，增减除联以外的其他联次，并确定其用途。