律师解答：
性质不同：借条是承认借款事实的书面凭证，而还款协议是当事人双方就还款事项达成一致约定的合同；调整的关系不同：借条调整的是出借人与借款人之间的借贷关系，还款协议调整的是出借人与借款人偿还借款或者债权人与债务人之间偿还欠款的法律关系。
【法律依据】：
《中华人民共和国民法典》 第六百六十七条 借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。